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| 分析内容 | 具体内容 |
| 1.数据质控 | |
| 2.数据质量汇总 | |
| 3.参考基因组比对 | 3.1 Reads 比对结果统计 3.2 比对区域分布 3.3 比对可视化 |
| 4.新基因预测 | 4.1 新基因结构注释 4.2 新基因功能注释 |
| 5.定量分析 | 5.1基因表达定量 5.2 基因表达分布 5.3 样本间相关性 5.4 主成分分析 |
| 6.差异分析 | 6.1 差异基因统计 6.2 差异基因列表 6.3 差异基因聚类 6.4 差异基因火山图 6.5 差异基因韦恩图 6.6 GO 富集分析 6.7 KEGG 富集分析 6.8 GSEA 富集分析 |
| 7.可变剪切分析 | 7.1 差异可变剪切分析 7.2 差异可变剪切绘图 |
| 8.SNP 变异位点分析 |
| 物种分类 | 部位 | 样本纵连高要求(单次文库构建） |
| 植物 | 根 | 常规材料≥500mg，特殊材料≥1g |
| 茎 | ||
| 叶 | ||
| 花 | ||
| 果实/种子 | ||
| 幼苗 | ||
| 动物 | 组织 | 常规材料≥200mg，特殊材料≥500mg |
| 细胞 | ≥2*106细胞 | |
| 全血（用于提取 RNA） | 全血≥4 ml | |
| Total RNA | 普通转录组/真核链特异性 | m≥1μg，RIN≥6.8（动物）、6.3（植物、真菌），基线平整 （软体等无 28S 物种） |
