多重PCR (multiplex polymerase chain reaction,mPCR) 也称复合PCR，针对目标序列设计带测序接头序列的多重PCR引物，通过PCR扩增富集目的片段，之后通过PCR扩增加上测序引物得到文库后进行二代测序。该技术简化目标样本基因组序列，极大的减少了冗余序列，并且降低了复杂样本研究对测序数据量的需求，因而可以更加快速的应用于基因组研究的整体解决方案中。